在商務辦公樓里，不管是什么類型的空調，最終目的都是保證工作者在這個樓里獲得一個舒適的環境，大概就是冬暖夏涼。但辦公大樓都是高密度人群聚集區，尤其是很多互聯網、金融行業還普遍存在加班的情況，中央空調系統往往很難確定運行范圍和運行調節機制。

如今大多數辦公樓的中央空調系統，一般是使用水系統或氟系統。水系統的中央空調以水為冷媒，舒適度較高，可避免夏季直接蒸發式空調的“強冷風感”及冬季集中供暖的“燥熱感”（也就是避免空調病）。而氟系統中央空調最大的優勢在于“高效”，更加節能省電。兩種系統各有的優勢，安裝時要根據自身的實際情況進行選擇。

在過渡性季節時，空調設計還要考慮全新風運行，直接利用室外較為涼爽的空氣來冷卻和改善室內沉悶的環境。